IV. Séquençage

Le séquençage de l’ADN consiste à déterminer l’ordre d’enchaînement des bases azotées (A,T,G,C) sur les brins de l’hélice d’ADN. C’est l’ordre de succession des bases qui constituent l’information de codage. Et c’est cette information qui va nous apporter une connaissance utile et certaine sur le fossile.

Le séquençage de l’ADN peut avoir deux fins principales différentes :

• découvrir une séquence encore inconnue (appelé séquençage “de novo”) : il s’agit alors d’identifier les enchaînements de nucléotides ;

• ou bien étudier une séquence déjà connue (“re-séquençage”) afin de découvrir des SNP (Single Nucleotide Polymorphisme ou polymorphisme d’un seul nucléotide), positions auxquelles un nucléotide unique diffère de la séquence de référence : l’enchaînement de nucléotides est connu, et on cherche à identifier une variation ou mutation par rapport à la séquence de base. C’est cette variation qui est alors l’information recherchée.

Nous développons ci-après les différentes méthodes de séquençage disponible.